A Flashback 2 2134-be repíti a játékosokat, egy futurisztikus cyberpunk világba, ahol az emberiség megalapította az Egyesült Világokat és gyarmatosította a Naprendszert. A főhős Conrad B. Hart, a Galaktikus Nyomozóiroda ügynöke, aki élete legnehezebb küldetésével néz szembe. Miután a Morphok – idegen lények, akik képesek emberi alakot ölteni – megtámadják, sérülten és részleges amnéziával ébred. A mechanikus karjába épített mesterséges intelligencia, az A.I.S.H.A. segítségével olyan útra indul, amely az egész civilizáció sorsát eldöntheti.
A történet középpontjában a Morphok elleni harc áll, akik kulcsfontosságú politikai vezetőket akarnak helyettesíteni, hogy átvehessék az uralmat az Egyesült Világok felett. Conrad változatos küldetéseket teljesít – vállalati laborokba való beszivárgás, harcok cyberpunk metropoliszokban és a Titán vad dzsungeleinek felfedezése. A játékosok fő- és mellékküldetéseket is végrehajtanak, amelyek erőforrásokat, fejlesztéseket és szövetségeseket biztosítanak. Ez a sokszínűség a Flashback 2-t az akció, a platform és a sci-fi kaland különleges keverékévé teszi.
Kalandja során Conrad múltjának titkait tárja fel, és rájön, hogy egy nagyobb kísérlet része. Az identitás és az emlékezet témái kulcsszerepet játszanak – a játékosoknak olyan kérdésekkel kell szembenézniük, mint a szabad akarat, a genetikai manipuláció és az emberi természet lényege. A történet felfedése, az ellenállással folytatott párbeszédek és a hatalmas ellenfelekkel vívott harcok fokozatosan növelik a feszültséget. A játék az intenzív harci jeleneteket elmélkedő pillanatokkal egyensúlyozza ki, modern cyberpunk környezetben.
A Flashback 2 csúcspontja egy epikus összecsapás a Morphokkal, ahol az intelligencia, a taktika és a játékos döntései határozzák meg a kimenetelt. A tét hatalmas – az emberiség jövője és szabadságának fennmaradása forog kockán. A dinamikus akció, a mély történet és a változatos helyszínek révén a játék tiszteleg az 1990-es évek klasszikusa előtt, miközben modernizálja azt az új generáció számára. Kötelező darab minden akció-, kaland- és sci-fi rajongónak.