بازی Hero of the Kingdom II داستان خواهر و برادری جوان را روایت می‌کند که در جستجوی خانه‌ای جدید، در سراسر یک پادشاهی پهناور سفر می‌کنند. پس از وقایع دراماتیکی که آنها را مجبور به ترک سرزمین مادری‌شان می‌کند، در یک روستای ماهیگیری کوچک پناه می‌گیرند. آنها به سرعت با اهالی روستا دوست می‌شوند، مهارت‌های جدیدی یاد می‌گیرند و در کارهای روزمره کمک می‌کنند.
اما این زندگی آرام مدت زیادی دوام نمی‌آورد؛ چرا که حملات دزدان دریایی به زودی تمام پادشاهی را تهدید می‌کند. قهرمانان شاهد حمله‌ای وحشیانه می‌شوند که خانه جدیدشان را نابود می‌کند و ساکنان روستا را پراکنده می‌سازد. با عزم راسخ برای یافتن خواهرش و کمک به اهالی روستا، قهرمان جوان وارد سفری خطرناک به سرزمین‌های ناشناخته می‌شود.
در طول این ماجراجویی، بازیکن از مکان‌های مختلفی عبور می‌کند؛ از جنگل‌های انبوه و دشت‌های وسیع گرفته تا مرداب‌های خطرناک و سواحل پرخطر که توسط دزدان دریایی تسخیر شده‌اند. در این مسیر، قهرمان با شخصیت‌های متعددی روبرو می‌شود که هر کدام داستان یا درخواستی دارند. با بهبود مهارت‌ها، جمع‌آوری آیتم‌ها و حل معماها، قهرمان قوی‌تر و باتجربه‌تر می‌شود.
داستان بازی حول محور شجاعت، وفاداری و فداکاری می‌چرخد. در نهایت، قهرمان باید با رهبر دزدان دریایی روبرو شود تا خواهرش و روستا را از نابودی نجات دهد. با تلاش و کمک دوستان جدید، او موفق به بازگرداندن صلح به سواحل شده و جایگاه خود را در دنیا پیدا می‌کند.
