Magical Bakery er et singleplayer-spil, der kombinerer madlavning og butikstyring i et fortryllende bageri fyldt med magiske ingredienser. Spilleren tager rollen som ejer af dette magiske bageri, hvor hver kage eller tærte kan indeholde spor af magi og tiltrækker alt fra feer til drager.
Gameplayet indebærer at bage kager, småkager og tærter ved hjælp af både klassiske opskrifter og fortryllede ingredienser. Spilleren skal lære at blande ingredienser korrekt, eksperimentere med trylleformularer og styre magiske reaktioner, som enten kan føre til fantastiske eller katastrofale resultater.
Ud over bagning skal spilleren også håndtere den daglige drift: betjene kunder, udvide butikken, ansætte hjælpere (som små bagernisser) og styre ressourcer. I takt med at spillet skrider frem, låses nye opskrifter, formularer og magisk udstyr op, hvilket gør det muligt at lave endnu mere unikke desserter.
Efterhånden som historien udvikler sig, opdager spilleren bageriets hemmeligheder og de gamle magiske opskrifters historie. Spillet byder på en afslappende, men udfordrende oplevelse i en eventyrlig verden, hvor magien både kan smages og mærkes.